铂尔曼,洗净。 - 美国澳门葡京app的研究人员已经开发出一种新方法来识别细菌先前未确认的抗生素抗性基因。

通过采用机器学习和博弈理论,研究人员能够确定与93至99%的精确度在三个不同类型的细菌的抗生素抗性基因的存在。研究人员,其中包括备受瞩目的杂志研究生阿布·赛义德·乔杜里和教授希拉broschat电气工程和计算机科学和道格拉斯电话在全球动物健康的保罗·艾伦所学校,报告自己的工作, 科学报告。

耐药菌的日益流行是在世界各地日益严重的问题。每年,数以百万计的人在美国感染了抗药性病原体,和成千上万的人死于肺炎或血液感染,这成为无法治疗死亡。

近年来,研究人员一直在利用基因组测序来识别抗生素抗性基因,寻找在公共数据库中的基因相似的序列。这适用于识别知名抗生素耐药性的基因,但不与新的或不正常的基因托起。

“似乎存在于自然界中的抗生素抗性基因蕴藏着巨大的,说:”打电话。 “这个工具使我们能够找出推测抗性基因基于与公共数据库的简单序列比较,不会有辨认。”

在工作中,澳门葡京app的团队决定采用博弈论,即在几个领域,特别是经济,用于游戏玩家之间的战略互动建模工具,以帮助识别抗生素抗性基因。在博弈论,模型确定一个参与者的行为是如何影响和依赖于其他玩家的行为。

使用他们的机器学习算法和博弈论的方法中,研究人员观察的遗传物质的若干特征,包括其结构和理化,进化和蛋白质序列,而不是简单地在其序列的相似性的组合物特性的相互作用。

Closeup of 希拉broschat
希拉broschat

“这种新的博弈论的方法是特别强大,因为功能都选择了它们是如何协同工作,以及作为一个整体来确定可能的抗生素抗性基因的基础上 - 既兼顾了实用性和功能相互依存,”说broschat。

研究人员能够使用的办法高精度识别抗生素抗性基因。

“在这两种抗生素耐药性的增长,可用的测序的基因组的数量,使用机器学习来预测耐药性代表了在该领域提供新的和更精确的工具显著的发展,”她说。

研究人员接下来将努力改善他们的模型,并开发一个用户友好的和公开的版本,以预测耐药性。这项工作是由卡尔·M部的资助。汉森的基础。

媒体联系方式:

道格拉斯电话,分子流行病学的试剂教授,全球动物健康,509-335-6313的保罗·艾伦学校, drcall@wsu.edu